Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clca4bQ3UW98 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clca4bQ3UW98 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms