Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clpsl2Q3UW21 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clpsl2Q3UW21 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms