Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Obox3Q3UT54 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Obox3Q3UT54 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms