Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc190Q3URK1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc190Q3URK1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms