Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
E130208F15RikQ3UPV3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms