Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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SbsponQ3UPR9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SbsponQ3UPR9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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