Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D13Ertd608eQ3UPR8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms