Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Arhgef40Q3UPH7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgef40Q3UPH7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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