Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Skap2Q3UND0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Skap2Q3UND0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms