Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Parp3Q3ULW8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Parp3Q3ULW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms