Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam83fQ3UKU4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fam83fQ3UKU4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms