Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ell2Q3UKU1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ell2Q3UKU1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms