Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc61Q3UJV1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc61Q3UJV1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms