Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms