Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Greb1Q3UHK3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Greb1Q3UHK3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms