Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rnf44Q3UHJ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf44Q3UHJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms