Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmed8Q3UHI4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tmed8Q3UHI4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmed8Q3UHI4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms