Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lrrc58Q3UGP9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrrc58Q3UGP9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms