Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Puf60Q3UEB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Puf60Q3UEB3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms