Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Yipf3Q3UDR8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Yipf3Q3UDR8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms