Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trafd1Q3UDK1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trafd1Q3UDK1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms