Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trip13Q3UA06 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms