Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Rnf166Q3U9F6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf166Q3U9F6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf166Q3U9F6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms