Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cops9Q3U898 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms