Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf149Q3U2C5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf149Q3U2C5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms