Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc9Q3U0M1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trappc9Q3U0M1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms