Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mbd6Q3TY92 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd6Q3TY92 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms