Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q3TTL0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3TTL0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms