Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Calr4Q3TQS0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Calr4Q3TQS0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Calr4Q3TQS0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms