Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctdnep1Q3TP92 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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