Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Smarca4Q3TKT4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Smarca4Q3TKT4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Smarca4Q3TKT4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms