Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp39Q3TIX9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp39Q3TIX9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms