Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TEI4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TEI4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TEI4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TEI4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TEI4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms