Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms