Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Defa26Q3L180 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms