Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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Shroom4Q1W617 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shroom4Q1W617 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Shroom4Q1W617 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
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Shroom4Q1W617 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shroom4Q1W617 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shroom4Q1W617 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shroom4Q1W617 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Shroom4Q1W617 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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Shroom4Q1W617 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms