Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sap25Q1EHW4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sap25Q1EHW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms