Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

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Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Myo3bQ1EG27 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Myo3bQ1EG27 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms