Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cers3Q1A3B0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cers3Q1A3B0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms