Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam47cQ14BE7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam47cQ14BE7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms