Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpusd2Q149F1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpusd2Q149F1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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