Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gli2Q0VGT2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gli2Q0VGT2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gli2Q0VGT2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms