Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc162pQ0VG85 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms