Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ttc39dQ0VF76 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Ttc39dQ0VF76 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Ttc39dQ0VF76 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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