Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b3Q0VF55 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b3Q0VF55 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms