Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samd12Q0VE29 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms