Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cntnap5bQ0V8T8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms