Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrriq1Q0P5X1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrriq1Q0P5X1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms