Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Spata18Q0P557 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spata18Q0P557 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms