Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ttc21bQ0HA38 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ttc21bQ0HA38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms